Phytophthora sp. es un fitopatógeno significativo que afecta frutos, tallos, hojas, brotes de cacao (Theobroma cacao L.) causando considerables pérdidas en la producción. La caracterización de cepas patógenas es de gran utilidad para optimizar el manejo de la enfermedad. Por esta razón, este estudio tuvo como objetivo evaluar la virulencia de Phytophthora sp. en brotes de cacao bajo condiciones controladas de cultivo in vitro. Inicialmente se llevó a cabo una caracterización morfológica de los aislados de Phytophthora. Posteriormente se inoculó este fitopatógeno en brotes desinfectados de dos variedades de cacao: Nacional fino de aroma y CCN-51, siguiendo un diseño completamente al azar factorial con siete repeticiones, utilizando los brotes como unidades experimentales. Las variables evaluadas incluyeron incidencia, severidad, resistencia y el área bajo la curva del progreso de la enfermedad, las cuales fueron evaluadas diariamente durante cuatro días. La identificación del género Phytophthora sp fue realizado mediante la prueba molecular con primers Internal transcribed spacer ITS4-ITS6. Los resultados mostraron que la incidencia y severidad en los brotes de cacao Nacional Fino de aroma alcanzaron el 100% cuando fueron infectados con la cepa PP8, evidenciando una alta susceptibilidad a la enfermedad conocida como como mazorca negra. En contraste, los brotes de cacao CCN-51 no presentaron ninguna infección por las cepas evaluadas. Se concluye que la virulencia de Phytophthora sp. muestra dependencia específica tanto de la cepa del patógeno como del hospedero. Estos hallazgos resaltan la importancia de considerar la variabilidad fenotípica del patógeno y la resistencia del hospedero para gestionar el manejo fúngico en cultivos de cacao.
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